Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCSO14618 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCSO14618 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms