Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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