Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB2P55268 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB2P55268 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB2P55268 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB2P55268 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB2P55268 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms