Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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