Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul1Q9WTX6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cul1Q9WTX6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cul1Q9WTX6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul1Q9WTX6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms