Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJB9

Tmem183, Transmembrane protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem183Q9JJB9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem183Q9JJB9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem183Q9JJB9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem183Q9JJB9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem183Q9JJB9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms