Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpf2Q9JJ80 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpf2Q9JJ80 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpf2Q9JJ80 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpf2Q9JJ80 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpf2Q9JJ80 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpf2Q9JJ80 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms