Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actrt2Q9D9L5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Actrt2Q9D9L5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actrt2Q9D9L5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms