Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm12Q9D0R8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm12Q9D0R8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm12Q9D0R8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms