Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM2

Kdelr2, ER lumen protein-retaining receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr2Q9CQM2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdelr2Q9CQM2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdelr2Q9CQM2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdelr2Q9CQM2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdelr2Q9CQM2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdelr2Q9CQM2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdelr2Q9CQM2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelr2Q9CQM2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr2Q9CQM2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdelr2Q9CQM2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdelr2Q9CQM2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdelr2Q9CQM2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdelr2Q9CQM2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdelr2Q9CQM2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdelr2Q9CQM2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms