Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpb2Q9CQI7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpb2Q9CQI7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpb2Q9CQI7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpb2Q9CQI7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpb2Q9CQI7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpb2Q9CQI7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpb2Q9CQI7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpb2Q9CQI7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpb2Q9CQI7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176 ms