Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnip2Q99JG7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip2Q99JG7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip2Q99JG7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip2Q99JG7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip2Q99JG7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip2Q99JG7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip2Q99JG7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip2Q99JG7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnip2Q99JG7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnip2Q99JG7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnip2Q99JG7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip2Q99JG7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip2Q99JG7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnip2Q99JG7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip2Q99JG7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms