Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sh2b1Q91ZM2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh2b1Q91ZM2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh2b1Q91ZM2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh2b1Q91ZM2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms