Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelenomQ8VHC3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SelenomQ8VHC3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SelenomQ8VHC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms