Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Brd3Q8K2F0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd3Q8K2F0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd3Q8K2F0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms