Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGW4

Sox30, Transcription factor SOX-30, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox30Q8CGW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox30Q8CGW4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox30Q8CGW4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox30Q8CGW4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox30Q8CGW4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox30Q8CGW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sox30Q8CGW4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox30Q8CGW4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox30Q8CGW4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox30Q8CGW4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox30Q8CGW4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox30Q8CGW4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox30Q8CGW4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox30Q8CGW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox30Q8CGW4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox30Q8CGW4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms