Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Iffo1Q8BXL9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Iffo1Q8BXL9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Iffo1Q8BXL9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms