Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN2

D3Ertd751e, UPF0462 protein C4orf33 homolog, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D3Ertd751eQ8BGN2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
D3Ertd751eQ8BGN2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D3Ertd751eQ8BGN2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
D3Ertd751eQ8BGN2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
D3Ertd751eQ8BGN2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms