Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrsam1Q80ZI6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrsam1Q80ZI6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrsam1Q80ZI6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrsam1Q80ZI6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms