Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Capn11Q6J756 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn11Q6J756 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn11Q6J756 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn11Q6J756 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms