Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp4aQ64436 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp4aQ64436 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp4aQ64436 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms