Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ChukQ60680 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChukQ60680 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChukQ60680 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChukQ60680 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChukQ60680 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChukQ60680 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChukQ60680 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ChukQ60680 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChukQ60680 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChukQ60680 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChukQ60680 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChukQ60680 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChukQ60680 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms