Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav3-1Q5R1I8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-1Q5R1I8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms