Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RilpQ5ND29 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RilpQ5ND29 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RilpQ5ND29 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RilpQ5ND29 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms