Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Eb2Q3UUV9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Eb2Q3UUV9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms