Protein–RNA interactions for Protein: Q2LA85

Treml2, Trem-like transcript 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml2Q2LA85 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Treml2Q2LA85 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml2Q2LA85 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Treml2Q2LA85 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Treml2Q2LA85 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Treml2Q2LA85 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Treml2Q2LA85 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Treml2Q2LA85 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms