Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.12□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 DAL80YKR034W 810 nt7.12□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 YOR012WYOR012W 414 nt7.12□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 LIP5YOR196C 1245 nt7.12□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 PPZ2YDR436W 2133 nt7.11□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 YLR112WYLR112W 420 nt7.11□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 NUP57YGR119C 1626 nt7.11□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 CDC3YLR314C 1563 nt7.09□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 TRR1YDR353W 960 nt7.09□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 MSB3YNL293W 1902 nt7.09□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 GUT1YHL032C 2130 nt7.09□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 CDC13YDL220C 2775 nt7.08□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 AFG3YER017C 2286 nt7.08□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 HHY1YEL059W 309 nt7.08□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 YER156CYER156C 1017 nt7.08□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 YMR206WYMR206W 942 nt7.08□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 RPS6AYPL090C 711 nt7.08□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 RPS6BYBR181C 711 nt7.08□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 BAP3YDR046C 1815 nt7.08□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 OPI1YHL020C 1215 nt7.07□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 Q0010Q0010 387 nt7.07□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 ATP2YJR121W 1536 nt7.06□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 PET18YCR020C 648 nt7.06□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 YPR084WYPR084W 1371 nt7.06□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 STE3YKL178C 1413 nt7.05□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 KIN1YDR122W 3195 nt7.04□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 SEC23YPR181C 2307 nt7.04□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 FCY1YPR062W 477 nt7.04□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 YOR389WYOR389W 1875 nt7.04□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 EXG2YDR261C 1689 nt7.03□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 MEU1YLR017W 1014 nt7.03□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 NUP84YDL116W 2181 nt7.03□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 EFM1YHL039W 1758 nt7.03□□□□□ -1.28
YMR226CQ05016 SSC1YJR045C 1965 nt7.02□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 GET2YER083C 858 nt7.02□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 INP54YOL065C 1155 nt7.02□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 MHP1YJL042W 4197 nt7.02□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 BDS1YOL164W 1941 nt7.01□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 YNL295WYNL295W 1575 nt7.01□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 YJL064WYJL064W 396 nt7.01□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 ICL2YPR006C 1728 nt7.01□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 YJL160CYJL160C 864 nt7□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 YML034C-AYML034C-A 399 nt7□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 RQC1YDR333C 2172 nt7□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 MCH2YKL221W 1422 nt6.99□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 EDC3YEL015W 1656 nt6.97□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 PAU19YMR325W 375 nt6.97□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 CCR4YAL021C 2514 nt6.97□□□□□ -1.29
YMR226CQ05016 CYB2YML054C 1776 nt6.96□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 RRP43YCR035C 1185 nt6.96□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 SWM1YDR260C 513 nt6.96□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 MTR3YGR158C 753 nt6.96□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 SEN2YLR105C 1134 nt6.96□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 SUN4YNL066W 1263 nt6.96□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 CMK2YOL016C 1344 nt6.96□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 ECM27YJR106W 2178 nt6.95□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 ARC35YNR035C 1029 nt6.95□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 YIL168WYIL168W 384 nt6.94□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 SNT309YPR101W 528 nt6.94□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 YPT10YBR264C 600 nt6.94□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 NTG1YAL015C 1200 nt6.93□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 MFT1YML062C 1179 nt6.93□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 RRN10YBL025W 438 nt6.93□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 RDR1YOR380W 1641 nt6.93□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 CDC7YDL017W 1524 nt6.91□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 PHO85YPL031C 918 nt6.91□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 TAH11YJR046W 1815 nt6.91□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 AMN1YBR158W 1650 nt6.9□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 UTR5YEL035C 501 nt6.9□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 MGM101YJR144W 810 nt6.9□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 DSC3YOR223W 879 nt6.9□□□□□ -1.3
YMR226CQ05016 YMR074CYMR074C 438 nt6.89□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 YPR127WYPR127W 1038 nt6.89□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 TDP1YBR223C 1635 nt6.89□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 SPS1YDR523C 1473 nt6.88□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.88□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 SMK1YPR054W 1167 nt6.88□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 YCP4YCR004C 744 nt6.87□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 PSA1YDL055C 1086 nt6.87□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 BIM1YER016W 1035 nt6.87□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 RPL2BYIL018W 765 nt6.87□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 YMR007WYMR007W 381 nt6.87□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 GSH1YJL101C 2037 nt6.86□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 ERS1YCR075C 783 nt6.86□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 AGP2YBR132C 1791 nt6.86□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 GPH1YPR160W 2709 nt6.86□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 PGI1YBR196C 1665 nt6.85□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 HBN1YCL026C-B 582 nt6.85□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 CCT3YJL014W 1605 nt6.84□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 SPR1YOR190W 1338 nt6.84□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 TDH1YJL052W 999 nt6.84□□□□□ -1.31
YMR226CQ05016 DAL7YIR031C 1665 nt6.84□□□□□ -1.32
YMR226CQ05016 YHR131CYHR131C 2553 nt6.83□□□□□ -1.32
YMR226CQ05016 YJR154WYJR154W 1041 nt6.83□□□□□ -1.32
YMR226CQ05016 YAL045CYAL045C 309 nt6.83□□□□□ -1.32
YMR226CQ05016 MIX17YMR002W 471 nt6.83□□□□□ -1.32
YMR226CQ05016 RPL43AYPR043W 279 nt6.83□□□□□ -1.32
YMR226CQ05016 OPI11YPR044C 354 nt6.83□□□□□ -1.32
YMR226CQ05016 PSP2YML017W 1782 nt6.82□□□□□ -1.32
YMR226CQ05016 ADH6YMR318C 1083 nt6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms