Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp10Q000W5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp10Q000W5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp10Q000W5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp10Q000W5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp10Q000W5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp10Q000W5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp10Q000W5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp10Q000W5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp10Q000W5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp10Q000W5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp10Q000W5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp10Q000W5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp10Q000W5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms