Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Meis3P97368 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Meis3P97368 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Meis3P97368 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis3P97368 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Meis3P97368 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Meis3P97368 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meis3P97368 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms