Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	PMU1	YKL128C	888 nt		5.81	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	YOR041C	YOR041C	432 nt		5.81	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	RPS6A	YPL090C	711 nt		5.81	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	RFS1	YBR052C	633 nt		5.81	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	RPS6B	YBR181C	711 nt		5.81	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	PPZ2	YDR436W	2133 nt		5.81	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	SKY1	YMR216C	2229 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	ARG7	YMR062C	1326 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	JHD1	YER051W	1479 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	YCP4	YCR004C	744 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	PET18	YCR020C	648 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	RUP1	YOR138C	2016 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	AIM3	YBR108W	2844 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	FRE5	YOR384W	2085 nt		5.79	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	YER152W-A	YER152W-A	567 nt		5.79	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	GNA1	YFL017C	480 nt		5.79	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	ERP2	YAL007C	648 nt		5.79	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	HAM1	YJR069C	594 nt		5.79	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	DPH5	YLR172C	903 nt		5.79	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	YMR007W	YMR007W	381 nt		5.79	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	TPO1	YLL028W	1761 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	SWM1	YDR260C	513 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	YJL160C	YJL160C	864 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	SLG1	YOR008C	1137 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	AOS1	YPR180W	1044 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	PDC5	YLR134W	1692 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VAR1	P02381	RCR1	YBR005W	642 nt		5.77	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	PUP1	YOR157C	786 nt		5.77	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	UBP13	YBL067C	2244 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	SRF1	YDL133W	1314 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	VMA2	YBR127C	1554 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	HAL5	YJL165C	2568 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	YER156C	YER156C	1017 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	MFT1	YML062C	1179 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	PEX28	YHR150W	1740 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	DST1	YGL043W	930 nt		5.75	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	RMD8	YFR048W	1989 nt		5.75	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	CLN1	YMR199W	1641 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	TKL2	YBR117C	2046 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	YHR033W	YHR033W	1272 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	LEO1	YOR123C	1395 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	RSP5	YER125W	2430 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	ATP2	YJR121W	1536 nt		5.73	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	CDC23	YHR166C	1881 nt		5.73	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	HGH1	YGR187C	1185 nt		5.72	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	PET10	YKR046C	852 nt		5.72	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	NOG2	YNR053C	1461 nt		5.71	□□□□□ -1.49
VAR1	P02381	SLX5	YDL013W	1860 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	HXT2	YMR011W	1626 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	UTR5	YEL035C	501 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	GTS1	YGL181W	1191 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	YBR284W	YBR284W	2394 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	NMT1	YLR195C	1368 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	TOS1	YBR162C	1368 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	CPR2	YHR057C	618 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	YIL168W	YIL168W	384 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	RQC1	YDR333C	2172 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	FET4	YMR319C	1659 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	HRA1	HRA1	564 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	SNA3	YJL151C	402 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	YPC1	YBR183W	951 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	GYP8	YFL027C	1494 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	SEC23	YPR181C	2307 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	ERV25	YML012W	636 nt		5.68	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	CAN1	YEL063C	1773 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	ENB1	YOL158C	1821 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	SNF7	YLR025W	723 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	VPS65	YLR322W	315 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	YML034C-A	YML034C-A	399 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	EFM1	YHL039W	1758 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	KIN1	YDR122W	3195 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	FLC2	YAL053W	2352 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	PAC10	YGR078C	600 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	TDH1	YJL052W	999 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	CAR2	YLR438W	1275 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	RTC2	YBR147W	891 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	BRN1	YBL097W	2265 nt		5.65	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	DCR2	YLR361C	1737 nt		5.65	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	TPI1	YDR050C	747 nt		5.65	□□□□□ -1.5
VAR1	P02381	YBL113C	YBL113C	2379 nt		5.65	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	STE3	YKL178C	1413 nt		5.65	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	CYC8	YBR112C	2901 nt		5.64	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	YDR215C	YDR215C	414 nt		5.64	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	RRN10	YBL025W	438 nt		5.64	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	HHY1	YEL059W	309 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	DAL80	YKR034W	810 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	INP54	YOL065C	1155 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	ADA2	YDR448W	1305 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	PET494	YNR045W	1470 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	YNL295W	YNL295W	1575 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	YAH1	YPL252C	519 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	RRP43	YCR035C	1185 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	YDR327W	YDR327W	327 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	GET2	YER083C	858 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	HNM1	YGL077C	1692 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	YJL043W	YJL043W	774 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	POP1	YNL221C	2628 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	TCB1	YOR086C	3561 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	SPR1	YOR190W	1338 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	HXK2	YGL253W	1461 nt		5.6	□□□□□ -1.51

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