Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Actn3O88990 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Actn3O88990 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Actn3O88990 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Actn3O88990 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Actn3O88990 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Actn3O88990 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn3O88990 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn3O88990 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn3O88990 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn3O88990 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Actn3O88990 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Actn3O88990 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actn3O88990 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Actn3O88990 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn3O88990 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn3O88990 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Actn3O88990 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms