Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-ObO35424 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-ObO35424 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms