Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r67G5E8C1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r67G5E8C1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r67G5E8C1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms