Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
2610021A01RikE9Q0Q3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms