Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cfap58B2RW38 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap58B2RW38 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap58B2RW38 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cfap58B2RW38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms