Protein–RNA interactions for Protein: A6H666

Cox8c, Cytochrome c oxidase subunit 8C, mitochondrial, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8cA6H666 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox8cA6H666 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8cA6H666 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8cA6H666 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cox8cA6H666 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms