Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Gm28171A0A087WQ19 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28171A0A087WQ19 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Gm28171A0A087WQ19 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Gm28171A0A087WQ19 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Gm28171A0A087WQ19 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Gm28171A0A087WQ19 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28171A0A087WQ19 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28171A0A087WQ19 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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