RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF148Q9UQR1 794 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RELNP78509 3460 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYSRT1A8MQ03 144 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F8W8V4 182 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF749O43361 778 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUN1O94901 812 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPN1P07384 714 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSTD2Q5T7W7 516 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATCAYQ86WG3 371 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPC24Q8NBT2 197 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5K2Q8NHB8 316 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCTN2Q96GX1 697 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RANBP9Q96S59 729 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIMKLBQ9ULI2 386 aa25.32■■□□□ 1.64
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGXTP21549 392 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADRA1DP25100 572 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCF4Q15080 339 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM69BQ5VUD6 431 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2A14Q96R47 310 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM60AQ9NP50 221 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLXIPLQ9NP71 852 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPHK1Q9NYA1 384 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6C2Q9NZP2 312 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9J4A7 227 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM1AO60341 852 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM63AO94886 807 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPBGLP0DKB5 382 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC25BP30305 580 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIA1P42261 906 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD97P48960 835 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6P1Q8NGX9 317 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4L1Q8NH43 312 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf54Q8WWF1 131 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB6BQ9NRW1 208 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0J9YY10 115 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2B3O76000 313 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACVR1Q04771 509 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRP9Q7RTR0 991 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF778Q96MU6 729 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASS4Q9NQ75 786 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKMY1Q9P2S6 941 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLAGL1Q9UM63 463 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PADI2Q9Y2J8 665 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED13Q9UHV7 2174 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTLL8A6PVC2 850 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEP78395 509 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX1Q13596 522 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZIC1Q15915 447 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB110Q30KQ9 67 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF534Q76KX8 674 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRUNE1Q86TP1 453 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC89Q8N998 374 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf62Q9BQA9 187 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHRS4Q9BTZ2 278 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSSK1BQ9BXA7 367 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSGA10Q9BZW7 698 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCAF1Q9Y4C2 921 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAV2Q8IVL1 2488 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC18AA5D8T8 446 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ISM1B1AKI9 464 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEACAM4O75871 244 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APRTP07741 180 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ETS1P14921 441 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABRA4P48169 554 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIR2DS3Q14952 304 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC18BQ6UXF7 455 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED25Q71SY5 747 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB2Q8N680 514 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC18CQ8NCF0 446 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAK5Q9P286 719 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC16AO15027 2179 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BMH7 237 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HCRTR1O43613 425 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT86O43790 486 aa25.26■■□□□ 1.63
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