RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421750.1

TRAPPC2P4-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 pseudogene 4, humanhuman

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Gene TRAPPC2P4, Length 331 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CADM3Q8N126 398 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RNF148Q8N7C7 305 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AMER3Q8N944 861 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FADS6Q8N9I5 356 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TRIM58Q8NG06 486 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OR52J3Q8NH60 311 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EXD1Q8NHP7 514 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ATP8B4Q8TF62 1192 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 XAGE5Q8WWM1 108 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SNX19Q92543 992 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NT5C3BQ969T7 300 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ULK4Q96C45 1275 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 R3HDM4Q96D70 268 aa3.35□□□□□ -1.87
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PGM2Q96G03 612 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EGLN2Q96KS0 407 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SPATA33Q96N06 139 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 C8orf49Q96NF6 230 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MUS81Q96NY9 551 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FEVQ99581 238 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CPNE1Q99829 537 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PKIBQ9C010 78 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TMEM245Q9H330 911 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PIGMQ9H3S5 423 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TOR3AQ9H497 397 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RIOX1Q9H6W3 641 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EXO5Q9H790 373 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ACTR8Q9H981 624 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CPNE5Q9HCH3 593 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 VAT1LQ9HCJ6 419 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GPR132Q9UNW8 380 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CLIC4Q9Y696 253 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KIF7Q2M1P5 1343 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LOC100653049A0A140TA62 436 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 A0A1W2PPW3 197 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MEI4A8MW99 385 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 H0YIG0 161 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AP4M1O00189 453 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CES2O00748 559 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PLSCR1O15162 318 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LRRTM2O43300 516 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PRAMEF10O60809 474 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 VPS26AO75436 327 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GCATO75600 419 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KRT34O76011 436 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ACSL3O95573 720 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FESP07332 822 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ASNSP08243 561 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NMBRP28336 390 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RGS7P49802 495 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RPS8P62241 208 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 IRX4P78413 519 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HSD11B2P80365 405 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC25A3Q00325 362 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EGR4Q05215 589 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NAE1Q13564 534 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CUL1Q13616 776 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CARTPTQ16568 116 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SOWAHAQ2M3V2 549 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DCST1Q5T197 706 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ARMC12Q5T9G4 340 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TBC1D9BQ66K14 1250 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CES5AQ6NT32 575 aa3.34□□□□□ -1.87
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