RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527549.5

TSTA3-206, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-206ENST00000527549 MMP2P08253 660 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 CDH3P22223 829 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 SERPINB6P35237 376 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 GABRA4P48169 554 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 ALS2CLQ60I27 953 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 GTF3C1Q12789 2109 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 MATN3O15232 486 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 FANCGO15287 622 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 RNF8O76064 485 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 UNC5CO95185 931 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 SMSP52788 366 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 FOXL2P58012 376 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 ITKQ08881 620 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 LONRF1Q17RB8 773 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 TSGA13Q96PP4 275 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 TRIB3Q96RU7 358 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 FOXC2Q99958 501 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 CDYLQ9Y232 598 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 RTTNQ86VV8 2226 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 EPHB6O15197 1021 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 KLHL18O94889 574 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 IGFBP2P18065 325 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 HLA-DPA1P20036 260 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 MST1P26927 711 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 IL1R2P27930 398 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 PCK1P35558 622 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 ARL4AP40617 200 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 GCGRP47871 477 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 LMAN1P49257 510 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 TNFSF10P50591 281 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 CSNK1G2P78368 415 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 GALNT2Q10471 571 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 NFE2L1Q14494 772 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 NR1I3Q14994 352 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 PARVAQ9NVD7 372 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.022e-8■■■□□ 17.9
TSTA3-206ENST00000527549 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-206ENST00000527549 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 ALOX12BO75342 701 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 HLA-DQB2P05538 268 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 FOSL1P15407 271 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 CTSCP53634 463 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 PRKAA1Q13131 559 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 KRT31Q15323 416 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 GPR135Q8IZ08 494 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 FKBP10Q96AY3 582 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 TRIM7Q9C029 511 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 WDR54Q9H977 334 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-206ENST00000527549 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms