RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00052Q96N35 136 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 ABCB9Q9NP78 766 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 ABCD2Q9UBJ2 740 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 CYTH4Q9UIA0 394 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 FAM92AA1XBS5 289 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00862A6NCI5 91 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA0513O60268 411 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 RAP2AP10114 183 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 GPX3P22352 226 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 TIE1P35590 1138 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 HMGCLP35914 325 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 SP4Q02446 784 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 MXD1Q05195 221 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 DSC1Q08554 894 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 PID1Q7Z2X4 250 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 UBA3Q8TBC4 463 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC32Q9BV29 185 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF639Q9UID6 485 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF222Q9UK12 451 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 EDARQ9UNE0 448 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 SMIM30A4D0T7 59 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC72A6NJI9 287 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 CLDN24A6NM45 220 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 WASHC1A8K0Z3 465 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 UGT2B17O75795 530 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 NPPAP01160 153 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 HGFP14210 728 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 F8A1P23610 371 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 CPT1AP50416 773 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 EPHA5P54756 1037 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 UGT2B15P54855 530 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 PER3P56645 1201 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 CTBP1Q13363 440 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 TAZQ16635 292 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 PYDC2Q56P42 97 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 LRFN4Q6PJG9 635 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 TEX261Q6UWH6 196 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 MARVELD3Q96A59 401 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 C19orf60Q96EN9 201 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 GALNT9Q9HCQ5 603 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 BFARQ9NZS9 450 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 MGAT4AQ9UM21 535 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 U3KQ87 197 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-203ENST00000395211 GLI3P10071 1580 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 PPP6CO00743 305 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00032P0C843 101 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 PFKLP17858 780 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 IGFBP5P24593 272 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 CHRNA5P30532 468 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 HTR7P34969 479 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TGM4P49221 684 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 DGKQP52824 942 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 NUDT6P53370 316 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TNK1Q13470 666 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF273Q14593 569 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 GPR19Q15760 415 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 AAK1Q2M2I8 961 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TSTD2Q5T7W7 516 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 KDELC1Q6UW63 502 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 HDDC2Q7Z4H3 204 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 LAX1Q8IWV1 398 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 SETD9Q8NE22 299 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms