RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	LRP8	Q14114	963 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TGFBI	Q15582	683 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	LIPM	Q5VYY2	423 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM74	Q86UV6	250 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	LONP2	Q86WA8	852 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GPSM1	Q86YR5	675 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	FRMD1	Q8N878	549 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM136A	Q96C01	138 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CNDP1	Q96KN2	507 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	C7orf26	Q96N11	449 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TRMO	Q9BU70	441 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PARVB	Q9HBI1	364 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	THAP1	Q9NVV9	213 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	OARD1	Q9Y530	152 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PR77	199 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	LAMTOR5	O43504	91 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	NPHS1	O60500	1241 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GFRA3	O60609	400 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNA4	P22459	653 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CNR2	P34972	360 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CLDN2	P57739	230 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	STX3	Q13277	289 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZSR6	202 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC63	Q8NA47	563 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PDPR	Q8NCN5	879 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	DLG3	Q92796	817 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	DRC3	Q9H069	523 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	FZD3	Q9NPG1	666 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	HAO1	Q9UJM8	370 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF112	Q9ULX5	631 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS38	A1L453	326 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529		A8MT66	165 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529		H3BM21	787 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	BGN	P21810	368 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	HNMT	P50135	292 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	HK3	P52790	923 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	THOP1	P52888	689 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	HERVK_113	P63132	956 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	IRX4	P78413	519 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	OCRL	Q01968	901 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	BST1	Q10588	318 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TERF2	Q15554	542 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CHI3L2	Q15782	390 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	VRK3	Q8IV63	474 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	NAT14	Q8WUY8	206 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	FOPNL	Q96NB1	174 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	FGF22	Q9HCT0	170 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SUFU	Q9UMX1	484 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR91	A4D1P6	747 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	FFAR2	O15552	330 aa		12.46	□□□□□ -0.41

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