RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493957.5

UBA3-211, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 3, humanhuman

TSL 3

Gene UBA3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3-211ENST00000493957 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 NFATC2Q13469 925 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 TPSAB1Q15661 275 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 C4orf22Q6V702 233 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 DET1Q7L5Y6 550 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 C11orf96Q7Z7L8 435 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 PIANPQ8IYJ0 282 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 NAGSQ8N159 534 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 MPP5Q8N3R9 675 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 GPR156Q8NFN8 814 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 STYXQ8WUJ0 223 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 CCDC74AQ96AQ1 378 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 TRIM51Q9BSJ1 452 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SCNM1Q9BWG6 230 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SMOXQ9NWM0 555 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SYBUQ9NX95 663 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 PADI4Q9UM07 663 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 IGF2RP11717 2491 aa11.5□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 OR2AG2A6NM03 316 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 AGAP14A8MT82 685 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 H7C0S8 307 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SGTAO43765 313 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 VEGFDO43915 354 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 ECEL1O95672 775 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 PSMA3P25788 255 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 AKT1P31749 480 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 FOXN2P32314 431 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 PDE1BQ01064 536 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 ITGA9Q13797 1035 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 PTK6Q13882 451 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 HES3Q5TGS1 186 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 CES3Q6UWW8 571 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SNX20Q7Z614 316 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 NXPE1Q8N323 547 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 RANBP9Q96S59 729 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 RMI1Q9H9A7 625 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 KLC4Q9NSK0 619 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 TBC1D29Q9UFV1 150 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 CRLS1Q9UJA2 301 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 APPL1Q9UKG1 709 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 RNF215Q9Y6U7 377 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 ACACBO00763 2458 aa11.49□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 HEATR9A2RTY3 570 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 A6NCN8 305 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 PRR19A6NJB7 356 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 OPA1O60313 960 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SNX2O60749 519 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 GOT2P00505 430 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 ITGALP20701 1170 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 ADRA1DP25100 572 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 NMBRP28336 390 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 HADHAP40939 763 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 C2orf54Q08AI8 447 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SEMA3AQ14563 771 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 PPP1R7Q15435 360 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 DBN1Q16643 649 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 INSCQ1MX18 579 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 TMEM220Q6QAJ8 160 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 XKR5Q6UX68 686 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 LRRTM4Q86VH4 590 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SERPINA9Q86WD7 417 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 NAT8LQ8N9F0 302 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.48□□□□□ -0.57
UBA3-211ENST00000493957 SLCO2A1Q92959 643 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms