RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618722.4

GGTLC2-205, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTLC2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-205ENST00000618722 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
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GGTLC2-205ENST00000618722 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.02■■□□□ 1.92
GGTLC2-205ENST00000618722 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
GGTLC2-205ENST00000618722 TRIM37O94972 964 aa27.01■■□□□ 1.91
GGTLC2-205ENST00000618722 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27■■□□□ 1.91
GGTLC2-205ENST00000618722 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27■■□□□ 1.91
GGTLC2-205ENST00000618722 SPG7Q9UQ90 795 aa27■■□□□ 1.91
GGTLC2-205ENST00000618722 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.99■■□□□ 1.91
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GGTLC2-205ENST00000618722 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.96■■□□□ 1.91
GGTLC2-205ENST00000618722 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.96■■□□□ 1.91
GGTLC2-205ENST00000618722 BAG6P46379 1132 aa26.96■■□□□ 1.91
GGTLC2-205ENST00000618722 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.96■■□□□ 1.91
GGTLC2-205ENST00000618722 NUDCQ9Y266 331 aa26.96■■□□□ 1.91
GGTLC2-205ENST00000618722 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
GGTLC2-205ENST00000618722 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
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GGTLC2-205ENST00000618722 HMOX1P09601 288 aa26.92■■□□□ 1.9
GGTLC2-205ENST00000618722 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.92■■□□□ 1.9
GGTLC2-205ENST00000618722 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
GGTLC2-205ENST00000618722 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
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GGTLC2-205ENST00000618722 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.9■■□□□ 1.9
GGTLC2-205ENST00000618722 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.9■■□□□ 1.9
GGTLC2-205ENST00000618722 NHSQ6T4R5 1651 aa26.89■■□□□ 1.9
GGTLC2-205ENST00000618722 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.88■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 KCNQ2O43526 872 aa26.86■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 PHKG2P15735 406 aa26.85■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.84■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.84■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.83■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.83■■□□□ 1.89
GGTLC2-205ENST00000618722 PLSCR1O15162 318 aa26.81■■□□□ 1.88
GGTLC2-205ENST00000618722 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.81■■□□□ 1.88
GGTLC2-205ENST00000618722 ANP32CO43423 234 aa26.8■■□□□ 1.88
GGTLC2-205ENST00000618722 FCHSD2O94868 740 aa26.79■■□□□ 1.88
GGTLC2-205ENST00000618722 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
GGTLC2-205ENST00000618722 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.79■■□□□ 1.88
GGTLC2-205ENST00000618722 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
GGTLC2-205ENST00000618722 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.79■■□□□ 1.88
GGTLC2-205ENST00000618722 PRKAR2BP31323 418 aa26.78■■□□□ 1.88
GGTLC2-205ENST00000618722 DCAF5Q96JK2 942 aa26.78■■□□□ 1.88
GGTLC2-205ENST00000618722 BTAF1O14981 1849 aa26.77■■□□□ 1.88
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GGTLC2-205ENST00000618722 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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GGTLC2-205ENST00000618722 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.75■■□□□ 1.87
GGTLC2-205ENST00000618722 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.74■■□□□ 1.87
GGTLC2-205ENST00000618722 NEFMP07197 916 aa26.74■■□□□ 1.87
GGTLC2-205ENST00000618722 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
GGTLC2-205ENST00000618722 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.73■■□□□ 1.87
GGTLC2-205ENST00000618722 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.72■■□□□ 1.87
GGTLC2-205ENST00000618722 RREB1Q92766 1687 aa26.71■■□□□ 1.87
GGTLC2-205ENST00000618722 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
GGTLC2-205ENST00000618722 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 ITGB4P16144 1822 aa26.69■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 TXNRD1Q16881 649 aa26.69■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.69■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 PIGBQ92521 554 aa26.68■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 MAP3K5Q99683 1374 aa26.68■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 CABP4P57796 275 aa26.67■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
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GGTLC2-205ENST00000618722 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.65■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.65■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.65■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 NBPF14Q5TI25 921 aa26.65■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 PROM2Q8N271 834 aa26.65■■□□□ 1.86
GGTLC2-205ENST00000618722 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.63■■□□□ 1.85
GGTLC2-205ENST00000618722 PALLDQ8WX93 1383 aa26.63■■□□□ 1.85
GGTLC2-205ENST00000618722 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
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GGTLC2-205ENST00000618722 LY75O60449 1722 aa26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-205ENST00000618722 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-205ENST00000618722 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-205ENST00000618722 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-205ENST00000618722 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-205ENST00000618722 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-205ENST00000618722 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
GGTLC2-205ENST00000618722 MRC1P22897 1456 aa26.59■■□□□ 1.85
GGTLC2-205ENST00000618722 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.58■■□□□ 1.85
GGTLC2-205ENST00000618722 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GGTLC2-205ENST00000618722 MRS2Q9HD23 443 aa26.57■■□□□ 1.84
GGTLC2-205ENST00000618722 ATG3Q9NT62 314 aa26.57■■□□□ 1.84
GGTLC2-205ENST00000618722 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.57■■□□□ 1.84
GGTLC2-205ENST00000618722 TEFQ10587 303 aa26.56■■□□□ 1.84
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