RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARID3AQ99856 593 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 AAASQ9NRG9 546 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 LCE2BO14633 110 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 AXIN1O15169 862 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 ST8SIA5O15466 376 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 EML3Q32P44 896 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDCA8Q53HL2 280 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 SIRT1Q96EB6 747 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 DACH1Q9UI36 760 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 NOD1Q9Y239 953 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADH1AP07327 375 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 Q6ZNB5 142 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 MEIOBQ8N635 442 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 PTGIRP43119 386 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 GTF2IP78347 998 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIM52Q96A61 297 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 CLDN10P78369 228 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 RELBQ01201 579 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 DKK1O94907 266 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 BMP1P13497 986 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 RASA1P20936 1047 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 OGFOD1Q8N543 542 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 A0A1W2PRU2 124 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 GNRH1P01148 92 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIM50Q86XT4 487 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 SCNN1DP51172 638 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 PTK7Q13308 1070 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC102BQ68D86 513 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 XAGE2Q96GT9 111 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM196BA6NMK8 535 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPINT1O43278 529 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 IL2RAP01589 272 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 BMP2P12643 396 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATP1A2P50993 1020 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 SCARF1Q14162 830 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZFP42Q96MM3 310 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L15C9J2P7 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L10C9JJH3 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L12C9JPN9 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L11C9JVI0 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L21D6R901 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L18D6R9N7 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L22D6RA61 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L19D6RCP7 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L20D6RJB6 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 UPP2O95045 317 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 GDF10P55107 478 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L24Q0WX57 530 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 SIX5Q8N196 739 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 MEN1O00255 615 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATG7O95352 703 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 INHAP05111 366 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 PSME1Q06323 249 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 CLN3Q13286 438 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 CNKSR1Q969H4 720 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARXQ96QS3 562 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms