RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598660.1

TMEM59L-204, Transcript of transmembrane protein 59 like, human

TSL 5

Gene TMEM59L, Length 1,683 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM59L-204	ENST00000598660	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
TMEM59L-204	ENST00000598660	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TMEM59L-204	ENST00000598660	APAF1	O14727	1248 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TMEM59L-204	ENST00000598660	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TMEM59L-204	ENST00000598660	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TMEM59L-204	ENST00000598660	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
TMEM59L-204	ENST00000598660	NEFM	P07197	916 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TMEM59L-204	ENST00000598660	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TMEM59L-204	ENST00000598660	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
TMEM59L-204	ENST00000598660	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM59L-204	ENST00000598660	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM59L-204	ENST00000598660	LRRC37A3	O60309	1634 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM59L-204	ENST00000598660	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM59L-204	ENST00000598660	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TMEM59L-204	ENST00000598660	NFE2L2	Q16236	605 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TMEM59L-204	ENST00000598660	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.89	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.88	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	NEUROD2	Q15784	382 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.88	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	POTEA	Q6S8J7	498 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	TNS2	Q63HR2	1409 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660		A0A0G2JS52	829 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	MYT1	Q01538	1121 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	RIPK4	P57078	832 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	CYP27B1	O15528	508 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	DDB1	Q16531	1140 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TMEM59L-204	ENST00000598660	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	EXOC5	O00471	708 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	PHKG2	P15735	406 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	RXRB	P28702	533 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	DCTN1	Q14203	1278 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TMEM59L-204	ENST00000598660	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	MCM10	Q7L590	875 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	CCDC27	Q2M243	656 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	RGS12	O14924	1447 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	WWC1	Q8IX03	1113 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	NGEF	Q8N5V2	710 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	LGR6	Q9HBX8	967 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	ZNF521	Q96K83	1311 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	PDE3B	Q13370	1112 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.19
TMEM59L-204	ENST00000598660	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
TMEM59L-204	ENST00000598660	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
TMEM59L-204	ENST00000598660	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TMEM59L-204	ENST00000598660	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TMEM59L-204	ENST00000598660	FAM182B	Q5T319	152 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TMEM59L-204	ENST00000598660	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TMEM59L-204	ENST00000598660	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		28.64	■■■□□ 2.17
TMEM59L-204	ENST00000598660	MRC1	P22897	1456 aa		28.64	■■■□□ 2.17
TMEM59L-204	ENST00000598660	WDR63	Q8IWG1	891 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TMEM59L-204	ENST00000598660	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
TMEM59L-204	ENST00000598660	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
TMEM59L-204	ENST00000598660	TEF	Q10587	303 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TMEM59L-204	ENST00000598660	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TMEM59L-204	ENST00000598660	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TMEM59L-204	ENST00000598660	GOLGA2	Q08379	1002 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TMEM59L-204	ENST00000598660	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TMEM59L-204	ENST00000598660	ITGB4	P16144	1822 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TMEM59L-204	ENST00000598660	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.58	■■■□□ 2.16
TMEM59L-204	ENST00000598660	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.16
TMEM59L-204	ENST00000598660	CABP4	P57796	275 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TMEM59L-204	ENST00000598660	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TMEM59L-204	ENST00000598660	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
TMEM59L-204	ENST00000598660	IL16	Q14005	1332 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TMEM59L-204	ENST00000598660	BCL9	O00512	1426 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TMEM59L-204	ENST00000598660	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16

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