RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583826.5

TSPOAP1-AS1-209, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,004 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SHANK3Q9BYB0 1731 aa39.22■■■■□ 3.87
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 FLT4P35916 1363 aa39.2■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 INSRP06213 1382 aa39.19■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa39.18■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 LRRC4BQ9NT99 713 aa39.18■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PTGER2P43116 358 aa39.17■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KIF24Q5T7B8 1368 aa39.16■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MTFR1LQ9H019 292 aa39.15■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CGNL1Q0VF96 1302 aa39.14■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 DCAF8L1A6NGE4 600 aa39.14■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ZNF827Q17R98 1081 aa39.14■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SLC27A3Q5K4L6 730 aa39.13■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 POLR3GLQ9BT43 218 aa39.13■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TATP17735 454 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa39.11■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NSD2O96028 1365 aa39.09■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 LY75O60449 1722 aa39.04■■■■□ 3.84
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SGIP1Q9BQI5 828 aa39.03■■■■□ 3.84
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa39.03■■■■□ 3.84
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa39.03■■■■□ 3.84
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 YY1P25490 414 aa39.01■■■■□ 3.84
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SYT17Q9BSW7 474 aa38.96■■■■□ 3.83
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa38.95■■■■□ 3.83
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 WASHC2AQ641Q2 1341 aa38.94■■■■□ 3.82
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CYP27B1O15528 508 aa38.93■■■■□ 3.82
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SLC16A10Q8TF71 515 aa38.93■■■■□ 3.82
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PKD1L3Q7Z443 1732 aa38.92■■■■□ 3.82
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NCAPD2Q15021 1401 aa38.91■■■■□ 3.82
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 POLKQ9UBT6 870 aa38.91■■■■□ 3.82
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa38.88■■■■□ 3.81
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 EYA1Q99502 592 aa38.87■■■■□ 3.81
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa38.86■■■■□ 3.81
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 UTRNP46939 3433 aa38.83■■■■□ 3.81
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MSH5O43196 834 aa38.81■■■■□ 3.8
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KLHL34Q8N239 644 aa38.8■■■■□ 3.8
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 COL24A1Q17RW2 1714 aa38.8■■■■□ 3.8
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TMOD3Q9NYL9 352 aa38.68■■■■□ 3.78
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 FLAD1Q8NFF5 587 aa38.66■■■■□ 3.78
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PHF14O94880 888 aa38.56■■■■□ 3.76
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 AMIGO3Q86WK7 504 aa38.55■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 LINC00116Q8NCU8 138 aa38.54■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ATG3Q9NT62 314 aa38.53■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ATP6V1AP38606 617 aa38.52■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SMIM5Q71RC9 77 aa38.52■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KIF7Q2M1P5 1343 aa38.52■■■■□ 3.76
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
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