RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567114.5

RPUSD1-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, human

TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD1-208	ENST00000567114	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
RPUSD1-208	ENST00000567114	MEGF6	O75095	1541 aa		33.58	■■■□□ 2.97
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZNF521	Q96K83	1311 aa		33.58	■■■□□ 2.97
RPUSD1-208	ENST00000567114	IL2RB	P14784	551 aa		33.58	■■■□□ 2.97
RPUSD1-208	ENST00000567114	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	AFF2	P51816	1311 aa		33.55	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		33.55	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		33.55	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		33.54	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		33.54	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	GOLGA2	Q08379	1002 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.53	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	VPS72	Q15906	364 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		33.51	■■■□□ 2.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	DCTN1	Q14203	1278 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	WDR63	Q8IWG1	891 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	MCM10	Q7L590	875 aa		33.48	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114		E9PSI1	815 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	SLFN5	Q08AF3	891 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	CYP27B1	O15528	508 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	PHKG2	P15735	406 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		33.4	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.4	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.4	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.39	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	EXOC5	O00471	708 aa		33.39	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	LGR6	Q9HBX8	967 aa		33.38	■■■□□ 2.93
RPUSD1-208	ENST00000567114	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
RPUSD1-208	ENST00000567114	IL16	Q14005	1332 aa		33.38	■■■□□ 2.93
RPUSD1-208	ENST00000567114	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		33.35	■■■□□ 2.93
RPUSD1-208	ENST00000567114	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		33.35	■■■□□ 2.93
RPUSD1-208	ENST00000567114	ATRN	O75882	1429 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RPUSD1-208	ENST00000567114	DDB1	Q16531	1140 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RPUSD1-208	ENST00000567114	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
RPUSD1-208	ENST00000567114	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
RPUSD1-208	ENST00000567114	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.93
RPUSD1-208	ENST00000567114	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114		A0A0G2JS52	829 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	GNAI1	P63096	354 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	MYT1	Q01538	1121 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	CFAP44	Q96MT7	982 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	IFT57	Q9NWB7	429 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZNF853	P0CG23	659 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	TEF	Q10587	303 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		33.26	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.92
RPUSD1-208	ENST00000567114	GLI3	P10071	1580 aa		33.26	■■■□□ 2.91
RPUSD1-208	ENST00000567114	MBIP	Q9NS73	344 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RPUSD1-208	ENST00000567114	CHL1	O00533	1208 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RPUSD1-208	ENST00000567114	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
RPUSD1-208	ENST00000567114	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		33.22	■■■□□ 2.91
RPUSD1-208	ENST00000567114	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
RPUSD1-208	ENST00000567114	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RPUSD1-208	ENST00000567114	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
RPUSD1-208	ENST00000567114	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RPUSD1-208	ENST00000567114	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		33.2	■■■□□ 2.91
RPUSD1-208	ENST00000567114	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.2	■■■□□ 2.9
RPUSD1-208	ENST00000567114	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
RPUSD1-208	ENST00000567114	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RPUSD1-208	ENST00000567114	CABP4	P57796	275 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RPUSD1-208	ENST00000567114	BTBD11	A6QL63	1104 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RPUSD1-208	ENST00000567114	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9

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