RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 MYL6BP14649 208 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 TNIP1Q15025 636 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 CAVIN4Q5BKX8 364 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 IL27Q8NEV9 243 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 DCTN1Q14203 1278 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 PIP4K2BP78356 416 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ATP2B2Q01814 1243 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 IFT57Q9NWB7 429 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 MNS1Q8NEH6 495 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 SMC2O95347 1197 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 TDO2P48775 406 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 HYPKQ9NX55 129 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 NAIPQ13075 1403 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 FAM177BA6PVY3 158 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 CAGE1Q8TC20 777 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 UBAC1Q9BSL1 405 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 MVPQ14764 893 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA0556O60303 1618 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 STK38Q15208 465 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 CBFA2T2O43439 604 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 FOSBP53539 338 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 PTPRCP08575 1304 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ADAMTS12P58397 1594 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 NEK4P51957 841 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 PDILTQ8N807 584 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 MSH6P52701 1360 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 KRT85P78386 507 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 AACSQ86V21 672 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 TSPY26PQ9H489 355 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ABCC5O15440 1437 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 A0A087WZG4 1122 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC192P0DO97 292 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 IQCEQ6IPM2 695 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 MTMR7Q9Y216 660 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 UGGT2Q9NYU1 1516 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 SRGAP3O43295 1099 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 MRE11P49959 708 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF76P36508 570 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 POTEJP0CG39 1038 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 SLC5A1P13866 664 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 METTL24Q5JXM2 366 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM5Q9C035 493 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-226ENST00000546160 RALGAPBQ86X10 1494 aa7.53□□□□□ -1.2
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