RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.98■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 MARCH6O60337 910 aa22.97■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.97■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.97■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 DISP1Q96F81 1524 aa22.97■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.97■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.96■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.96■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 ME1P48163 572 aa22.96■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 NFE2L2Q16236 605 aa22.96■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 WASHC4Q2M389 1173 aa22.96■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.96■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 TAF3Q5VWG9 929 aa22.95■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.95■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.95■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.94■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 CEP89Q96ST8 783 aa22.94■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 SERPINC1P01008 464 aa22.94■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.94■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 ERICH4A6NGS2 130 aa22.94■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.93■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.93■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.93■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.93■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 A2MP01023 1474 aa22.92■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.92■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 STRN4Q9NRL3 753 aa22.92■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 ABCC11Q96J66 1382 aa22.92■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 FERMT3Q86UX7 667 aa22.92■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.92■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 CAMK4Q16566 473 aa22.91■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.91■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 CFAP45Q9UL16 551 aa22.91■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 H0YHG0 523 aa22.91■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.91■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.9■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 ERICH2A1L162 156 aa22.9■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 PTPN14Q15678 1187 aa22.9■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
SUDS3-204ENST00000543473 SRGAP3O43295 1099 aa22.89■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 MX1P20591 662 aa22.89■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 UBXN4Q92575 508 aa22.89■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.89■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.89■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 CAGE1Q8TC20 777 aa22.88■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 SEC24BO95487 1268 aa22.88■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 NME9Q86XW9 330 aa22.88■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 ADCY5O95622 1261 aa22.88■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.88■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.88■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.87■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 PBRM1Q86U86 1689 aa22.87■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.87■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.87■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 JMYQ8N9B5 988 aa22.87■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 SNX21Q969T3 373 aa22.86■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 ATP2B1P20020 1258 aa22.86■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.86■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 KDM4AO75164 1064 aa22.86■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 G3V3G9 751 aa22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 TNNT1P13805 278 aa22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 SMARCE1Q969G3 411 aa22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 ABCC2Q92887 1545 aa22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 KIF18AQ8NI77 898 aa22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 NUCB1Q02818 461 aa22.84■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms