RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.98■■□□□ 1.27
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SUDS3-204ENST00000543473 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.97■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.97■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SUDS3-204ENST00000543473 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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SUDS3-204ENST00000543473 DISP1Q96F81 1524 aa22.97■■□□□ 1.27
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SUDS3-204ENST00000543473 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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SUDS3-204ENST00000543473 SEC24BO95487 1268 aa22.88■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 NME9Q86XW9 330 aa22.88■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 ADCY5O95622 1261 aa22.88■■□□□ 1.25
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SUDS3-204ENST00000543473 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.88■■□□□ 1.25
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SUDS3-204ENST00000543473 SNX21Q969T3 373 aa22.86■■□□□ 1.25
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SUDS3-204ENST00000543473 SMARCE1Q969G3 411 aa22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 ABCC2Q92887 1545 aa22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 KIF18AQ8NI77 898 aa22.85■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 NUCB1Q02818 461 aa22.84■■□□□ 1.25
SUDS3-204ENST00000543473 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.84■■□□□ 1.25
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